"Фильмы" о белковых молекулах помогут при создании лекарств

11 ноября 2010 года

Испанские ученые создали самую большую в мире базу данных, содержащую видеоролики о движении белковых молекул, эта "видеотека" может помочь при создании новых лекарств, сообщает пресс-служба Института биомедицинских исследований в Барселоне в четверг.

Белковые молекулы в живых клетках находятся в постоянном движении, и это надо обязательно учитывать при изучении их свойств. До недавнего времени ученые не располагали мощными информационными ресурсами, позволяющими исследовать динамику большого числа белков.

Сотрудники Института биомедицинских исследований (Барселона, Испания) после четырех лет работы с помощью суперкомпьютера MareNostrum впервые создали самую большую в мире базу данных по динамике белков. Названная своими создателями MoDEL, она содержит от 10 тысяч до 100 тысяч различных фотографий без малого 2 тысяч белковых молекул, на основе которых ученые создали видеоролики, позволяющие наблюдать за движениями конкретных молекул в растворе.

"В настоящее время лекарства разрабатываются так, как если бы белки, с которыми они должны взаимодействовать, были статичны. Такой подход часто приводит к неудачам, но благодаря новой базе данных эту проблему можно решить", - сообщил руководитель работы Модесто Ороско (Modesto Orozco).

Для своей базы данных испанские ученые, в свою очередь, брали изображения белковых молекул из международного каталога Protein Data Bank. По словам создателей MoDEL, поскольку многие белки схожи по своей структуре, то в реальности новая база данных содержит видеоролики о динамике 40% таких биомолекул с известной структурой.

Как утверждают ученые, созданный ими ресурс сейчас позволяет получать информацию о почти трети всех белков человека, которые могут стать потенциальными "мишенями" для новых лекарств, например, против рака и воспалительных заболеваний. Тем не менее, MoDEL будет пополняться, и в ближайшие два-три года в ней разместится информация о 80% человеческих белков.